1. 分离规律与自由组合规律的区别是基因分离规律，即等位基因分离现象。这一定律主要意味着等位基因实际上是相互独立的。自由结合定律是说非等位基因可以相互结合。这一定律所指出的是非等物的基因可以任意结合在一起。

2. 事实上，自由结合规律和分离规律都是在减数分裂中出现的，两者之间的联系是同时发生的。所谓基因分离定律是一对相对性状由Aa遗传，而自由组合定律是两组或两组以上的相对性状可以由后代或父母自由重组。